卷首语

关键词：卷首语科学研究能力科研活动基本粒子宇宙演化生命现象社会系统科学规律

在当代科研活动中，计算已经成为与理论、实验鼎足而立的第三个支柱。人们用计算的方法研究从基本粒子、生命现象到宇宙演化、社会系统等各种问题，极大改变和拓展了传统的研究方法，推动了新学科领域的产生和科学研究能力的革命性发展。计算已经成为发现新现象、认识科学规律、进行工程设计不可替代的手段，在科学研究和技术创新中所发挥十分重...
不同层次MPI并行程序容错的比较

关键词：mpi 容错检查点设置回卷恢复

随着超级计算机系统规模的不断扩大和系统结构的日益复杂，系统容错已经成为大规模超级计算机系统必须解决的一个关键问题。MPI并行程序的容错也日益受到关注，其中检查点设置和回卷恢复是MPI并行程序容错中一种重要的容错技术。本文对MPI标准、各种版本MPI实现的容错情况及检查点设置／回卷恢复的容错技术进行了介绍，给出了深腾7000t不同层次M...
基于GPU集群的科学计算可视化平台的性能测试与分析

关键词：可视化 visit gpu集群计算过程可视化科学计算可视化

应用于高性能计算集群的科学计算可视化软件发展日趋成熟，GPU加速的应用使得这类软件处理大规模数据的能力不断提高。本文介绍了可视化软件Vislt在GPU集群上安装及性能测试的一些工作，探讨了包括Vislt的基本架构、安装过程中遇到的问题及其解决方案、Vislt图像绘制中的并行性能测试、计算过程可视化的实现。
LSSC-III集群的作业调度与系统管理

关键词：linux集群作业调度系统管理

“科学与工程计算国家重点实验室”（LSEC）的三号集群LSSC—III，于2010年3月建成并投入使用。在总结了实验室前两套Pc机群的作业调度与系统管理经验的基础上，我们开发了一系列基于OpenPBS和Maui的适应于科学计算Linux集群用户的作业提交、调度与系统管理脚本。本文详细介绍了LSSC—III的作业调度与系统管理方案，以期能为中小规模集群（结点...
基于批量作业提交的网格门户的设计与实现

关键词：网格门户批量作业提交动态授权

传统的网格Portal大多不能很好地满足用户同时提交多作业的需求。本文提出了一个支持批量作业提交、可动态精确授权的网格计算门户。提供了简单易用的作业管理系统，支持作业的批量提交、作业状态的实时查看、作业的批量重做及终止、结果文件批量下载等功能；实现了基于LBAP的全网格用户认证及管理；根据批量提交的特点设计了基于组和个数受限应...
超级计算集群的安全防护

关键词：超级计算集群安全防护计算性能

由于具有很高的计算能力和存储空间，超级计算集群是攻击者眼中具有吸引力的目标，安全形势不容乐观。本文从超级计算集群的特点出发，分析了它可能面临的安全风险，结合运行经验和其追求性能最大化的实际，有针对性的给出内外兼顾的综合防护措施。
应用运行特征的快速分析方法

关键词：性能优化微架构应用运行特征分析实际浮点计算性能实际内存带宽代码向量化比例

性能优化是高性能计算领域的核心技术，而应用运行特征分析是确定性能瓶颈和优化方向的关键技术。本文在探讨常规系统级性能指标的同时，提出实际浮点计算性能Gflops、实际内存带宽、代码向量化比例等CPU微架构级关键性能指标，针对大规模应用软件的运行特征分析提出可视化数据收集方法和可视化定量统计分析方法，从而实现高效、准确、全面的了...
数据流软件Flobus在地震勘探资料处理中的应用

关键词：地震勘探地震勘探资料数据数据流数据驱动并发

地震勘探资料数据处理是地震勘探重要而不可缺少的组成部分，当前地震勘探资料数据处理具有处理的数据量大、处理过程多以及资料的重新处理，反复处理等典型特征。因传统的地震勘探资料处理系统中各个处理模块之间采用临时文件的方式来传递数据，这些特征反映到传统的地震勘探资料处理系统中将面临的一个核心问题：巨大的磁盘I／O访问量。这个磁...
钛铝金属间化合物中位错相互作用的原子尺度模拟

关键词：钛铝位错位错偶点缺陷原子模拟

本文对钛铝金属间化合物中的位错偶湮灭和位错反应进行原子尺度模拟研究。结果显示，位错偶并未发生完全的湮灭，而是转变为依赖于位错偶高度和温度的多种稳定构型，低温下形成空腔、垂直和倾斜等构型，高温下形成空位团簇等复杂构型；位错的直接相互作用可以产生高浓度的、多种形式的空位，自间隙原子和层错偶极子等缺陷。这些位错相互作用的产...
NWCHEM软件在生物体系中的应用

关键词：nwchem 并行计算深腾7000 多肽

生物体系结构和功能比较复杂，对其进行简单的振动柔性分析，研究构象变化以及原子分子之间相互作用势的精确度问题等都非常费时费力。我们可以将研究体系分割成合适的小片段后，使用量子化学程序进行精确计算，再采用MFCC结合REMD技术来研究生物体系精确作用问题。本文使用NWCHEM软件计算不同规模大小的“多肽”体系在深腾7000的不同架构节点上...
基于GPU的超级计算系统在ADS散裂靶设计中的应用

关键词：ads 核废料加速器散裂靶 gpu

从长期发展来看，核电作为一种清洁、高效的新型能源，是中国调整能源结构、缓解常规能源供应压力和减少温室气体排放的必然选择。然而，发展核电的安全性问题以及核废料处理问题是当前世界范围内研究的前沿问题。ADS，即加速器驱动的次临界系统，它能够有效嬗变核废料。本文介绍了利用GPU超算平台来实现ADS项目的相关设计模拟工作，目前自行开...
水平分辨率对WRF模式的影响研究——以黑河流域WRF模拟为例

关键词：weather sting model 水平分辨率黑河流域

水平空间分辨率对于模式模拟影响的验证一直是大气模型重要的研究内容，提高分辨率能够细致描述地形、下垫面状况等区域特征．准确的下垫面信息对于区域大气模拟的精度具有显著的影响。本文对区域大气模型Weather Research and ForecastingModel（WRF）在黑河流域进行5km和1km的对比试验，检验水平分辨率对WRF模拟精度的影响。通过与黑河综合遥...
海洋1.5层约化重力准地转模式的并行化

关键词：并行计算准地转模式并行化

并行计算技术是高性能并行计算系统中的一个研究热点，本文首先介绍了并行计算的基本概况，并将基于MPI的并行计算技术引入到海洋1．5层约化重力准地转模式并行化的研究中，然后详细介绍了准地转模式的并行方案和实现过程，并通过数值试验证明了并行后的计算效果有显著提高。
基于GPU超级计算系统的天文科学应用

关键词：信息化并行计算高性能计算数据处理数值模拟

天文学主要通过观测来收集天体的各种信息。现代天文学已经成为计算密集型学科，无论是海量观测数据处理，还是理论模型计算和数值模拟，都需要强大的计算能力支撑。GPU高性能、并行的通用计算架构的出现使得改变这种情况成为现实。本文将介绍中国科学院紫金山天文台基于GPU超级计算系统开发的图像处理与分析、数值模拟方法，及其在移动天体目标...
OpenMP在悬架实时动力学中的应用

关键词：悬架动力学实时 openmp

悬架动力学模型中应用的串行算法满足不了车辆实时性的要求，本文延续原有的动力学模型，尝试了一种并行算法（OpenMP），将之应用于悬架动力学，并改写了悬架动力学程序，经模拟结果验证，实时性得到了很大的提高。
“中国科学院超级计算发展指数”

关键词：中国科学院计算应用研究员新华网

2011年11月7日，在第一届中国科学院超级计算应用大会上，中国科学院超级计：算总中心主任迟学斌研究员代表中国科学院了“中国科学院超级计算发展指数”。新华网、科学网、
第二届中国科研信息化发展研讨会

关键词：科研信息化信息化发展中国科学与工程信息技术资源交流活动模式科研组织

科研信息化是充分利用信息技术、促进科技资源交流、汇集与共享、变革科研组织与活动模式、推动科技转型的一个重要手段。可以说，科研信息化正在引发21世纪科学与工程的变革。
《科研信息化技术与应用》征稿启事

关键词：信息化技术征稿启事应用科研网络信息中心中国科学院科学出版社学术性刊物

《科研信息化技术与应用》是中国科学院计算机网络信息中心、科学出版社共同主办的一份综合性、学术性刊物，旨在反映一前世界范嘲内科研信息化技术与应用的最新发展现状，

科研信息化技术与应用杂志

科研信息化技术与应用学术信息

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应用运行特征的快速分析方法

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