贵州省2014—2017年麻疹病毒分离株血凝素基因特征

摘要：目的分析贵州省2014—2017年麻疹病毒分离株的血凝素(Hemagglutinin,H)基因特征。方法采集贵州省2014—2017年疑似麻疹病例的咽拭子标本,采用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒,提取病毒核酸,经RT—PCR方法扩增麻疹病毒H基因全序列,对序列测定、拼接,分析基因特征。结果共获得83株H基因全序列的麻疹病毒分离株,均为H1a基因型,且有2个明显分支(Cluster A和Cluster B)。分离株H基因之间核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8%-100%和98.0%-100%;与H1a基因型参考株(China93—4)的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.6%-98.9%和98.2%-98.7%;与中国疫苗株(S191)的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.1%-94.5%和94.5%-95.2%。分离株均在第240氨基酸位点由丝氨酸变异为天冬酰胺(S—N),第243氨基酸位点由精氨酸变异为甘氨酸(R—G),处于Cluster A簇中的病毒株第397氨基酸位点由脯氨酸变异为亮氨酸(P—L)。结论贵州省2014—2017年麻疹病毒优势流行株为H1a基因型,且不同病毒传播链持续循环;麻疹病毒H蛋白基因的主要氨基酸位点未发生变异。