两种HLA分型方法对比
作者： 黑龙江八一农垦大学; 黑龙江大庆163319; 集美大学; 福建厦门361021
摘要：对比两种HLA分型方法的准确率,通过使用polysolver方法和研究出的新方法这两种方法对100个个体的全基因组外显子测序数据(WES)进行分型,然后将两种方法的分型结果与这100个个体的sanger一代测序结果进行比较,找到新方法的优点和不足,并且为动物MHC基因研究提供算法基础。经过新方法的开发以及优化,最终与polysolver方法的结果进行比较,得出结论,发现研究的新方法与polysolver分型方法相比准确率相对较高,且运行时间相对较短。两种方法均只能对HLA一类分子进行分型,这一点在将来实验中会进一步改进。
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