摘要：目的比较16S rRNA序列分析法与传统生化分析法鉴别54株分枝杆菌模式菌株的异同。方法采用PCR方法扩增54株分枝杆菌模式菌株16S rRNA序列,通过序列比对构建发育树状谱,计算相似性,并与传统生化分析分型结果进行比较。结果16S rRNA序列分析可鉴定出41株(41种)分枝杆菌,其它6组(包括13株11种)的分枝杆菌16S rRNA序列两两之间相同无法区别,传统的生化分析方法难以区分鸟分枝杆菌和胞内分枝杆菌、龟分枝杆菌和偶然分枝杆菌,但采用16S rRNA很容易区分;16S rRNA基因无法区分海分枝杆菌与溃疡分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌,但采用传统生化分型方法很容易区分。结论在分枝杆菌的分型鉴定方面,分枝杆菌16S rRNA基因序列分析与传统分型均十分有效,且两者的联合应用,能够提高鉴定的准确性。