摘要：随着实验方法的改进和技术的发展，酵母双杂交系统、质谱仪、蛋白质芯片等实验手段越来越广泛地应用在研究蛋白质的结构、功能和相互作用上，积累了大量数据，为研究新的蛋白质的结构和功能打下基础。这些数据大都通过公共数据库实现数据共享。蛋白质科学的数据库不仅数据数量庞大，而且数据类型众多，不同类型数据之间的关系复杂，难以进行深层次的数据加工。