油菜抗病基因同源序列克隆与分析
作者： 陕西理工大学生物科学与工程学院; 汉中723001; 陕西理工大学陕西省资源生物重点实验室; 汉中723001; 陕西理工大学体育学院; 汉中723001
摘要：为加快油菜抗病基因克隆,促进抗菌核病油菜育种。本研究根据已知NBS类植物抗病基因保守区P-loop和GLPL设计的兼并引物,对具有菌核病抗性的‘中双9号’油菜材料进行扩增,PCR产物克隆测序。采用NCBI中的BLAST进行序列比对,DNAMAN 6.0查找ORF并翻译成氨基酸序列,CDD查找蛋白保守域,通过MEGA 5构建系统发育树。结果显示:20条测序序列中,有1条序列(KB A1)与甘蓝型油菜类抗病基因RGA14相似性较高,该序列编码蛋白包含NBS-LRR类蛋白质的NB-ARC保守结构域。MEGA5进化树分析表明该序列与拟南芥RPM1、RPP8抗病基因编码蛋白聚在一起。推测该序列可能与油菜抗病基因相关,或者是抗病基因的一部分。本研究为进一步对该序列进行表达分析,研究其与油菜抗病性的关系提供理论依据。
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