马铃薯MYB转录因子基因的序列分析

摘要：MYB基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。本研究通过生物信息学方法对美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information, NCBI)中筛选的16条马铃薯MYB基因进行分析,预测其分子量和等电点等理化性质、基序、二级结构和三级结构,并用MEGA 5.0与已报道具有明确功能的20个MYB蛋白进行多序列比对分析并构建系统进化树。结果表明:马铃薯中筛选出16个的MYB基因蛋白大小在104~379 aa,分子量和等电点分别介于66 877.11~147 918.09 k D和4.95~5.16之间;基序预测得到3个特征基序,最长的基序含50个氨基酸;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋-转角-螺旋结构;进化树分析中,其中StMYB12与SIMYB12同源性高,StMYBA1、St AN1和StMYB113与矮牵牛AN2同源性高,StMYB21与MdMYB1有同源性,推测马铃薯的St MYB12、St MYBA1、StAN2、St AN1、StMYB113和StMYB21可能参与花青素合成代谢调控,这为下一步马铃薯花色素苷合成调控相关MYB基因功能研究提供参考依据。